2002—2011年
    2001年，国家科技部、财政部、中编办三部委以国科发政字[2001]428号文下发了《关于对水利部等四部门所属98个科研机构分类改革总体方案的批复》的文件，我所被列为转为科技型企业的单位。2002年1月水利部以水人教[2002]12号文件决定将“水利部农村电气化研究所”划归“南京水利科学研究院”管理。由于国家对公益类科研院所的改革政策不配套等原因，改革无法推进，我所还继续保留科研事业单位法人年审，在财务与资产方面，仍是中央二级预算事业单位，所有的资产仍是事业非经营性资产，工资体系也一直按事业单位体系和政策执行……(详见PDF文档)

2005年，水利部副部长索丽生...

 

2008年，水利部副部长周英...